MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Zymomonas mobilis subsp. mobilis ATCC 29191 plasmid pZZ6.03

Total Repeats: 109

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018148	TAAA	2	8	1	8	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018148	A	6	6	6	11	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018148	TTTAT	2	10	21	30	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018148	TAA	2	6	35	40	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018148	GGT	2	6	41	46	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018148	A	7	7	78	84	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018148	TTA	2	6	88	93	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018148	A	6	6	375	380	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018148	CTG	2	6	409	414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_018148	ATG	2	6	432	437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018148	CTT	2	6	438	443	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_018148	ATT	2	6	561	566	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018148	A	6	6	625	630	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018148	CCT	2	6	1145	1150	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_018148	AAT	2	6	1252	1257	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018148	GGC	2	6	1406	1411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_018148	TCT	3	9	1445	1453	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_018148	CGC	2	6	1467	1472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_018148	CAT	2	6	1476	1481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_018148	TCCC	2	8	1580	1587	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
21	NC_018148	CT	3	6	1588	1593	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_018148	T	6	6	8503	8508	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018148	GAA	2	6	8525	8530	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018148	ACG	2	6	8687	8692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_018148	TGCC	2	8	8705	8712	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
26	NC_018148	GC	3	6	8757	8762	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27	NC_018148	GC	3	6	8773	8778	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28	NC_018148	A	7	7	8796	8802	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018148	GCA	2	6	8839	8844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_018148	TAA	2	6	8903	8908	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018148	A	7	7	8923	8929	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018148	AAT	2	6	8957	8962	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018148	AT	3	6	9108	9113	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018148	AT	3	6	9120	9125	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018148	ATC	2	6	9154	9159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_018148	TGT	2	6	9227	9232	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018148	T	7	7	9232	9238	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018148	A	7	7	9244	9250	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018148	A	8	8	9264	9271	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018148	ATC	2	6	9680	9685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_018148	AT	3	6	9742	9747	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018148	CGTA	2	8	9823	9830	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_018148	A	7	7	9853	9859	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018148	AGG	2	6	9947	9952	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018148	T	6	6	9980	9985	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018148	GA	3	6	10049	10054	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018148	T	7	7	10078	10084	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018148	AG	3	6	10110	10115	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018148	TAA	2	6	10163	10168	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018148	TGT	2	6	10179	10184	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018148	CTG	2	6	10190	10195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_018148	TCG	2	6	10206	10211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_018148	TCT	2	6	10258	10263	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_018148	CTT	2	6	10271	10276	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_018148	ATT	2	6	10277	10282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018148	ATA	2	6	10289	10294	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018148	A	6	6	10321	10326	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018148	ATA	2	6	10339	10344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018148	T	7	7	10358	10364	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018148	TAA	3	9	10371	10379	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018148	T	6	6	10380	10385	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018148	AAT	2	6	11103	11108	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018148	ATT	2	6	11122	11127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018148	T	8	8	11144	11151	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018148	TTTATA	2	12	11156	11167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018148	ATT	2	6	11182	11187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018148	T	6	6	11193	11198	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018148	AT	5	10	11211	11220	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018148	ATA	2	6	11254	11259	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018148	ATA	2	6	11266	11271	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018148	A	7	7	11317	11323	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018148	AAT	2	6	11401	11406	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018148	A	6	6	11411	11416	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018148	GATT	2	8	11431	11438	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018148	C	7	7	11466	11472	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
76	NC_018148	A	6	6	11488	11493	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018148	T	6	6	11496	11501	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018148	GCT	2	6	12818	12823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_018148	AAAG	2	8	12848	12855	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018148	AT	3	6	12890	12895	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018148	GTT	2	6	12916	12921	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018148	GAA	2	6	12930	12935	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018148	AAT	2	6	12961	12966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018148	CTG	2	6	12971	12976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_018148	AAAT	2	8	12977	12984	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018148	GT	3	6	12987	12992	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018148	CTT	2	6	13015	13020	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_018148	TCTT	2	8	13026	13033	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_018148	ATAA	2	8	13034	13041	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018148	GAT	2	6	13099	13104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018148	A	6	6	13111	13116	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018148	G	6	6	13123	13128	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018148	CAA	2	6	13136	13141	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_018148	TCA	2	6	13148	13153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_018148	TAGA	2	8	13203	13210	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018148	ATA	2	6	13242	13247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018148	TCT	2	6	13258	13263	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_018148	A	6	6	13331	13336	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018148	A	6	6	13387	13392	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018148	ATA	2	6	13407	13412	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018148	GGT	2	6	13510	13515	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018148	A	6	6	13536	13541	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018148	AAT	3	9	13580	13588	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018148	A	7	7	13635	13641	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018148	T	6	6	13646	13651	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018148	A	7	7	13656	13662	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018148	AT	3	6	13691	13696	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018148	TAT	3	9	13700	13708	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018148	T	7	7	13731	13737	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.